29 сентября 1937 г. было создано Управление Народного Комиссариата Внутренних Дел (НКВД) по Краснодарскому краю.

После того как 13 сентября 1937 г. был упразднён Азово-Черноморский край и создан Краснодарский край, 29 сентября 1937 г. было упразднено Управление Народного Комиссариата Внутренних Дел по Азово-Черноморскому краю и на его базе были созданы Управления Народного Комиссариата Внутренних Дел по Ростовской области и Краснодарскому краю. Первым начальником Управления НКВД по Краснодарскому краю был майор И.П. Малкин. В конце 1930-х гг. были репрессированы многие сотрудники Управления НКВД по Краснодарскому краю.

В деятельности сотрудников Управления НКВД по Краснодарскому краю в годы Великой Отечественной войны можно выделить несколько направлений, в течение нескольких периодов:

—   борьба с немецкой разведкой до оккупации Краснодарского края;

— деятельность органов государственной безопасности края в период немецкой оккупации;

— период ликвидации последствий немецкой оккупации выявление и привлечение к ответственности предателей и пособников фашизма.

В настоящее время это Управление ФСБ России по Краснодарскому краю.