14 ноября 1959 г. было образовано Краснодарское краевое управление лесного хозяйства и охраны леса.
Краснодарское краевое управление лесного хозяйства и охраны леса было образовано постановлением Совета Министров РСФСР. Позже в 1988 г. Краснодарское краевое управление лесного хозяйства вошло в состав созданного Комитета природных ресурсов по Министерства природных ресурсов Российской Федерации.
В настоящее время Краснодарское краевое управление лесного хозяйства и охраны леса это Министерство природных ресурсов Краснодарского края. Министерство природных ресурсов Краснодарского края было создано 8 июня 2009 г. В настоящее время Министерство природных ресурсов Краснодарского края является органом исполнительной власти Краснодарского края, уполномоченным принимать участие в реализации государственной политики в сфере охраны окружающей среды, регулирования отношений в области недропользования, в области охраны и использования животного мира и других мероприятиях.